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给阎润涛解释为什么XylE是朝外的

(2019-08-04 02:43:40) 下一个

阎润涛追着问"再说了,你就算把glut1看出是马,XlyE是斑马,你有过证据证明XlyE开口朝里朝外变形的生化数据吗?glut1没有,XlyE 也没有啊"

回答如下:

这个不需要生化数据. 知道N端与C端都是面向细胞内的(这是基本知识), 实在不知道的话,颜2014的paper里也写了: “XylE contains a typical MFS fold of 12 TMs, with amino and carboxy terminal both located on the intracellular side. " 。  根据这一拓扑性质,(至少可以追溯到1987年) 拿到了晶体结构一看就知道是朝里还是朝外的了。

颜宁2012做了与3个底物的XylE的晶体,晶体结构显示都是朝外的。 这是不需要生化数据的。 2014图5不是每个元素都需要生化数据。

拿到了2012XylE朝外的结构图,2014就先做个朝里的Glut1.  这是根据1997年的文献Schurmann的指点。

Schurmann, A. et al. Role of conserved arginine and glutamate residues on the
cytosolic surface of glucose transporters for transporter function. Biochemistry 36, 12897–12902 (1997).
  

 

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阅读 ()评论 (3)
评论
Fanreninus 回复 悄悄话 很好的文,和他辩论,有很大的难度,一是很多专业的东西他不懂,二是即使懂他也不会承认对自己观点不利的,大阎的问题除了太自负外,就是把科学当政治看,把现实当故事编,不仅没有起码的专业操守,还没有做人的基本良心和道德。:)
SwiperTheFox 回复 悄悄话 回复 'cowwoman' 的评论 :

原来是这样。 不指望改变他的想法了,就是想在大众中间以正视听。 
cowwoman 回复 悄悄话 老阎可是工农兵大学生。他在乡下干了好多年才上大学的,你能指望他基础知识有多好?中国刚恢复大学教育,大学水平肯定也很差。你们在这里一直希望他正规化,好像很难办到。他就是死不认账,死抵赖。自己也没专业头衔,想怎么胡说就怎么胡说。
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