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英国的新冠突变

(2020-12-21 06:01:53) 下一个

英国的新冠突变

这几天不少媒体报道了英国发现的多突变的新冠病毒病毒株B.1.1.7, ,引起了不少人的警觉,因为有这个突变的病毒和最近在英国的肯特郡(Kent)以及其它一些地方的疫情攀升有关。

前天英国首相鲍里斯说因为有这个突变的病毒的高传染性,英国将采取更为严密的封城措施。这个消息一传出,让不少伦敦人惊慌失措,纷纷逃离那里,造成了火车拥挤和恐慌,欧洲好几个国家因怕英国人会携带着病毒一起逃到那里,连忙宣布禁航。

据说加拿大也限制了来自英国的航班,目前为止已经有26个国家禁止或限制了来自英国的航班,可能还会更多的国家跟进,这架势很有点像当初的中国,到处不受欢迎。有意思的是中国并没有禁止发自英国的航班。美国好像也没有,不仅没有,两天前还听说英国在和美国协商解除现有的限制。

目前还不知道B.1.1.7的来源,有一点可以肯定它不是007变来的,只知道最早是在九月份发现的,据估计它是在英国本土上由其它的毒株发展而来,有这么多突变可能是在某个病人体内长期存在不断突变的结果,也有可能是在人体内时,大量接触抗血清或者抗病毒药物,承受更大的所谓的“进化”压力造成的。

那么B.1.1.7比其它的毒株厉害吗?答案是不一定或者没有人知道。目前知道的唯一一点就是这个突变株的突变率很高,在发现的时候已经有14个氨基酸突变了,对于新冠病毒来说是算快的,据估计其它毒株的突变速度是每个月一到两个突变,所以到目前为止,多数新冠病毒和武汉的最早病毒相比有几个到20几个左右的氨基酸是不同的。

B.1.1.7这些突变不仅比较快,而且影响可能比较大,因为其中有一半在刺突蛋白上,两个可能影响刺突蛋白和受体的亲和力,从而促进或者影响病毒进入细胞的能力,另外一个是在所谓的弗林蛋白酶裂解的旁边,也可能会影响病毒的致病性。

由于这些,加上最近在肯特郡和其它地方发现的病人多为此株,一些人猜测这些突变可能增强病毒的感染力,不过,这个目前只是猜测而已。以前对在很多病人中出现的另外一个毒株也有类似的猜测,后来发现并非如此,该株比较多的原因是更多的人有接触其携带者造成的,B.1.1.7也可能如此。其次,就是没有发现这个毒株引起的感染在严重程度或者病死率上比其它毒株要重。

还有一个不清楚的问题是这些突变是否会影响疫苗的效果,现在的假设或者希望是疫苗在体内可以刺激免疫系统产生多种能够和刺突蛋白不同部位结合的抗体,即使一个地方突变了,其它地方依然能被抗体结合让疫苗依然有效。可由于这个毒株在刺突上的突变比较多,是否会更可能影响疫苗效果目前还不清楚。如果有影响的话,只有像流感一样,再研发新的疫苗。 

总之,目前对英国出现的B117毒株,除了知道其在病人中的分布比较多,是一个优势毒株外,其它的都知道的不多,由于其突变位于刺突等关键部位,并且在病人中分布比较广,有人认为它的毒性可能比较大,甚至有可能影响疫苗的效果。 

不过这些目前都是假设,要看是否到底这样,需要做进一步的监测和研究,这也是英国和其它国家的科学家目前正在做的,在有答案之前,值得警觉,却没有必要恐慌。对于一般人来说,防控新冠的唯一办法还是继续采取现有的防控措施,减少外出,必须外出时注意保距和戴口罩,有疫苗时一定要去打。

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阅读 ()评论 (37)
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石油附中啊 回复 悄悄话 英航停飞,至少表面上是航空公司层面的事情。其它航空公司减少航班很大程度上也是因为旅客大量减少。

英国的机场很厉害,当时对到港旅客完全什么都不查。心大。
枕寒流 回复 悄悄话 石油附中啊 发表评论于 2020-12-21 08:23:51
英国在今年年初新冠初起的时候,是不是也没有禁航中国吧? 我记得只是英航停飞了一段时间,还有些航空公司减少了航班。

中国很重视这一类互相对等的面子事儿的。
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+1,中式政治正确。不过民航有熔断机制,也不算没防范。国内的隔离监管追踪得可邪忽了。病毒在中国想活命得在突变超长潜伏期方面下功夫,哈哈。
Stegy223 回复 悄悄话 回复 '赌城看客' 的评论: 谢谢提示。
好久没见到看客了。问好!
赌城看客 回复 悄悄话 回复 'Stegy223' 的评论 : 如果有很多患者“ORF8 Q27stop”就好了,记得3月份新加坡报道ORF8的缺失,可后来没有报道了。如有兴趣可狗一下“ORF8 29”。
Stegy223 回复 悄悄话 回复 'cn_abcd' 的评论:
即使对mRNA疫苗产生的纯S蛋白,机体产生的是多克隆抗体。这些抗体分子各自识别S1亚基特别是ACE 受体结合区域的不同 抗原位点(epitopes). 目前见到的氨基酸突变数还有限,应该不会影响到大部分抗原住点。疫苗应该仍有效。
cn_abcd 回复 悄悄话 回复 'Stegy223' 的评论 :
这是不是意味着可以同时感染上两种病毒,那是不是也有可能疫苗也对其中一种无效?
Stegy223 回复 悄悄话 回复 'tianrui16' 的评论:
一种担心就是在免疫缺陷症者或某种中间动物不为人查知的慢性感染会因为环境选择的压力不同和感染时间久了产生不可预知情况,包括重组。
Stegy223 回复 悄悄话 回复 'tianrui16' 的评论:

那几个可能真正影响蛋白功能的氨基酸变异和删除突变单独或不同组合方式己经在全球各地变异株中测到过,所以这些突变本身并不让人吃惊。但一下子集中到了同一株,就有二种可能:这一株经历了加速突变,不是不可能。但目前观察到的突变率是比较稳定的。另一个可能就是如一名患者同时感染了二株,这就有重组的可能性了,表现为一下子突变快了。
tianrui16 回复 悄悄话 多谢解释, 您的意思是说,这个英国毒株可能属于新旧毒株在人体内糅合后,又产生的新毒株?所以不一定走寻常路线

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Stegy223 发表评论于 2020-12-21 15:17:39



对于现在这株英国新冠担心的是它本身可能是个自然重组株。有猜测重组可能发生于一名末知的“慢性”带病者身上。如重组继续发生效果无法预测
Stegy223 回复 悄悄话 回复 'tianrui16' 的评论: 谢谢!

总体讲病毒的演化是有这个规律。不是病毒要这么变,是进化选择的结果。毒性太大很快将宿主致命的病毒传不远。一个极端的例子是Ebola,患者都来不及离开非洲。所以自然选择下来传开的是毒性低潜伏期长的株。

对于现在这株英国新冠担心的是它本身可能是个自然重组株。有猜测重组可能发生于一名末知的“慢性”带病者身上。如重组继续发生效果无法预测。

“是不是可以这样理解,随着传染力的增强,病毒的繁殖力会变小,

drosten年初是这样科普的, 说如果存在不同地区病毒链的竞争,病毒变异规律就会传染性越来愈高。毒性变小,他说萨斯的消失, 就是在传播中忽然丧失了自我复制能力”

Fanreninus 回复 悄悄话 回复 'tianrui16' 的评论 : 是的,注意到那个采访了,谢谢!
Fanreninus 回复 悄悄话 回复 'Stegy223' 的评论 : 谢谢提供更详细的信息!我没有写得很详细,只是想泛泛而谈一下。
也跟着下面cn_abcd博友提供的链接去看了一下你的新文,写得很好。
Fanreninus 回复 悄悄话 回复 '三丝' 的评论 : 他可能是说那些突变会不会影响现在这个mRNA疫苗的效果。
Fanreninus 回复 悄悄话 回复 '老天真' 的评论 : 不管什么疫苗从设计到使用都会有一个过程,mRNA疫苗应该是最快的。目前还没有发现可以明显影响疫苗效果的突变。
至于采取防控措施,中国估计会做得好些,美国大概做得不会太好,破罐破摔。
Fanreninus 回复 悄悄话 回复 '鲁钝' 的评论 : 哈哈,应该说是人类自己,即使是病毒也是人类对自然的贪得无厌地开发造成的。
Fanreninus 回复 悄悄话 回复 '雨止风停' 的评论 : 理论上是的,这些突变的后果目前还未知!
Fanreninus 回复 悄悄话 回复 '注册很麻烦' 的评论 : 不知道是不是真的比其它毒株厉害。
Fanreninus 回复 悄悄话 回复 'voiceofme' 的评论 : 病死率没有变!
Fanreninus 回复 悄悄话 回复 '石油附中啊' 的评论 : 可能有,但英国应该不是最积极的。
tianrui16 回复 悄悄话 作为一个外行人,对于您的评论, 是不是可以这样理解,随着传染力的增强,病毒的繁殖力会变小,

drosten年初是这样科普的, 说如果存在不同地区病毒链的竞争,病毒变异规律就会传染性越来愈高。毒性变小,他说萨斯的消失, 就是在传播中忽然丧失了自我复制能力

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tegy223 发表评论于 2020-12-21 13:57:29
好文!

对这个英国的新冠突变有一点值得一提。B.1.1.7株在ORF8上有一个突变,使这个本来121氨基酸的蛋白在第27氨基酸后就终止了。这株新冠的ORF8应该是废了。己知ORF8对病毒复制非必需但有协助病毒适应宿主的功能。之前发现有ORF8 deletion突变使新冠在培养的人呼吸道表皮细胞中的复制稍慢下来点。
tianrui16 回复 悄悄话 德国的专家drosten 也接受采访,说没人知道这 70%的增速是怎么来的, 英国专家也说了,除了人数多, 一切都是猜测, 要等进一步研究,感觉是小金毛这次想封锁, 又怕下面反对, 就找了一篇论文做文章, 不想一下子玩大了,各国纷纷断航了
Stegy223 回复 悄悄话 好文!

对这个英国的新冠突变有一点值得一提。B.1.1.7株在ORF8上有一个突变,使这个本来121氨基酸的蛋白在第27氨基酸后就终止了。这株新冠的ORF8应该是废了。己知ORF8对病毒复制非必需但有协助病毒适应宿主的功能。之前发现有ORF8 deletion突变使新冠在培养的人呼吸道表皮细胞中的复制稍慢下来点。

三丝 回复 悄悄话 回复 '鲁钝' 的评论 :
super bug 可以要人命的。
三丝 回复 悄悄话 回复 '老天真' 的评论 :
英国刚刚开始接中 mRNA疫苗 (12 月),而病毒突变在8-9月就发生了。所以和mRNA疫苗 无关。
但英国有10k+参加了 牛津大学的疫苗临床,从5月份-9月份。不知道有无影响
老天真 回复 悄悄话 辉瑞和Moderna疫苗都是以S蛋白为唯一靶点设计的mRNA疫苗,而S蛋白的序列是八个月前公布的。新的病毒变种,将是对它们的考验。英国恰恰是最先大规模使用mRNA疫苗的地区,只要观察这些接受了mRNA疫苗者,在三个月内有多少被新变种病毒感染和发病,有十万例的追踪就够了。现在说什么都太早。
中国和美国如果还不及时阻断可能来自英国的感染源,将是一个不负责任的冒险行为。
鲁钝 回复 悄悄话 我觉得细菌对人类已经是无能为力了,是可控的。将来灭亡人类的一定是病毒。
雨止风停 回复 悄悄话 病毒突变的趋势一般是感染力增强而毒力减弱。
注册很麻烦 回复 悄悄话 这不雪上加霜啊
voiceofme 回复 悄悄话 关键是病死率。九月份发现新病毒变异,现在应该有数据得知病死率。看UK这几天的MOTALITY RATE, 一天感染30K,死亡300个,好像病死率是1%,和现有病毒一样。
石油附中啊 回复 悄悄话 英国在今年年初新冠初起的时候,是不是也没有禁航中国吧? 我记得只是英航停飞了一段时间,还有些航空公司减少了航班。

中国很重视这一类互相对等的面子事儿的。
Fanreninus 回复 悄悄话 回复 'cn_abcd' 的评论 : 第二篇博主的文章我很少看,我不喜欢抢眼或者拿人家东西渲染自己的文章,原文的东西也只是一个初步观察,是否能hold up还要其他人证实。很快读了一篇,好像也没有提到会致癌,另外和mRNA疫苗没有关系,因为mRNA是不会进到胞核的。
Fanreninus 回复 悄悄话 回复 '昔我往矣今我来思' 的评论 : 谢谢来访!
Fanreninus 回复 悄悄话 回复 'cn_abcd' 的评论 : 第一篇博主我比较了解,比较认真客观,写的很忠实原著,最主要的一点就是在感染后六个月体内的抗体虽然有所下降,但依然有很多B细胞对新冠病毒记忆犹新,这些所谓的记忆B细胞再次见到病毒时会马上产生很多抗体,抑制病毒复制,防止染病。如果种疫苗后也是这样就好,如果病毒不突变的话,会一劳永逸,至少会管很久。
cn_abcd 回复 悄悄话 能不能评论一下:
https://www.wenxuecity.com/blog/202012/75502/23765.html



https://www.wenxuecity.com/blog/202012/61002/23423.html

谢谢
昔我往矣今我来思 回复 悄悄话 好文,正希望凡人讲一下这个突变的,没想到就来了:)
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