波城新语 - 笑人也笑己，笑笑无坏意， 读读就算了，千万别生气！
冬雪倘雅淡，不走也不嫌，春風若溫暖，遲到也喜歡。
武汉肺炎有多少
英国一个牛人Neil M. Ferguson昨天基于国际报道的三例病人推算目前至少有1,723 武汉肺炎的病人。今天我想和苗大哥一起来分析一下这篇文章和这个数据的可靠性。
(付古笋文的链接：https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/sph/ide/gida-fellowships/Report.pdf）
首先说他们是如何算的，简单的一句话，就是蒙的。懂得流行病学的人都知道，在没有所需的数据的情况下，很多人都靠一些估计或者说假设（assumptions）来推测，虽然是可以理解甚至可以接受的，但多数情况下还是基于一些比较可靠的数据加上一两项估计的。而这些人则在只知道三例国际病人的情况下，做出了非常大胆的“推测”，目的无非是两个，一抢先发文；二引起轰动。问题是这种做法的科学性却很值得商榷，首先看看这些人是怎么算的，一步一步地看，你可以的！：）
一，潜伏期 - 从被感染到发病的时间，估计为5.5天 （4-6天）
二，发现期 - 从发病到被发现时间，估计为 4.5天（4-5天）
三，平均发现期 =潜伏期 （5.5） + 发现期 （4.5）=10 天
四，日均国际航行概率 = 每日从武汉向国外飞的乘客数 （3301人）/武汉机场日均流域人数 （19000000）= 0.00017373684
五，任一病例在海外被发现的概率=日均国际航行概率 （0.00017373684）X 平均发现期 （10）=0.0017373684
六，总病例数 = 海外发现病例的数目（3）/任一病例在海外被发现的概率 （0.0017373684）=1765。这个数据和他们的稍有出于，我估计我们和他们用的平均发现期有一点差别，因为我们不知道他们是用的10，11或者9天，我们觉得很靠近，就不去细究了。
简单吧！首先，坐在那里不动就可以写出有国际影响的论文了，因为数据不是假设就是估计的；其次，莫说理工男女了，连文史男女都不要，有小学算术水平即可算出。就连我这个把小学算术都忘了的电大生都觉得真TMD的简单。所以，如果你是英文专业或者中国文学专业毕业在国外想转行的话，不一定要去学电脑搞IT，你可以直奔流行病学，英文名叫epidemiology，记好了！还有，搞流行病学在国外不仅可以像这位大牛那样闭门造数出名，还可以赚大钱呀！
问题是这些东西准吗？ 首先，这种算法是基于所有接触者都有可能患病，事实并不是如此简单，这是因为目前并没有出现大流行，大多数人都不是带毒者，在机场流域人数中可能带毒者可能是百分之一，可能是千分之一，也可能是万分之一。这个可能性没有考虑进去就不可靠。
其次，即使有接触，也不是所有的人都会有相同发病率的，发病率大小取决于免疫力的低高。如果说接触者中发病的可能性是1/100甚至是1/1000的话，这个也没有考虑进去。
第三，退一步说，就算这些人算的是对的，按照这个反推，那些从武汉到达旅客越多的地方，发病人数应该越多，如果是那样的话，在国内其它城市或者港澳台应该人数更多，因为武汉飞往这些地方的远大于目前国外发现病人的城市，可是目前情况并非如此。
第四，作者用SARS和MERS的潜伏期和发现期来估计武汉肺炎的潜伏期和发现期，却偏偏不用死亡率这个重要指标作为估计。我在《武汉冠病毒肺炎》文里提到，SARS的死亡率在10%，MERS的是30-40%。
凭着这些死亡率数据反推，我们根本不需要机场和国外病人的数据就可以搞出病人的数目。公式很简单, 总病人数 = 死亡人数 / 死亡率。按SARS的10%算法是2/(10%)=20人；按MERS的算法是2/(30%)=6人。
实际上的总病例是65-70人之间，那么死亡率呢应该在3%。这个应该是靠谱的，一方面说明这个病是可以致死的，不可轻视，另一方面也说明这种病毒比SARS或MERS的毒性都要低很多。
如果按该作者的1765例为基数算呢，死亡率应该 = 2/1765 X100 = 0.1%，这样的死亡率比流感的（0.1-2.5%）还要低，真是如此的话，人们还要那么慌张干什么呢？不用慌张的话，中国当局为什么要去隐瞒呢？
实际上，宝爷的不少电大同窗和朋友这次战斗在抗武汉肺炎一线，所见所闻都和官方的报道差不多，他们这次在通报病情时接受了上次SARS的教训，同时抱着负责任的态度，谨慎，及时，客观，透明，既不掩饰数据，又不让群众在没有必要的情形下出现恐慌。
事实是目前病人数没有那么多，一切都在掌控中，这个不会因为喜欢炒作的英国人的一篇文章而改变的。
当然，这个病不会一下就被控制住，根据SARS和MERS的流行情况看，大概会持续八九个月才会得以控制，就是说从现在到六七月份，病例还会进一步增多，国内的专家们在春运期间都不会掉以轻心，他们都在严正以待加强控防措施，争取早日铲除这个牛鬼蛇神。
为防止该病传入或流行于美国，美国疾病预防和控制中心将派人对旧金山，纽约JFK和洛杉矶三大机场对从武汉来的乘客进行检测。据中心官员估计，该病对美国的威胁比较低，在来美乘客中其它病毒引起的呼吸道感染会远远高于武汉肺炎病毒肺炎，该官员预计在整个美国将会发现一个武汉肺炎的病人，所以，流行的可能性很小，但对于这种新的病毒，CDC还是不敢掉以轻心，也会到机场去采取其遇到新病毒时所常用的检测措施。
https://blog.wenxuecity.com/myoverview/76361/
回复：什么情况？
我是“闲人”，是来“合稀泥”的。
我看了那篇今井夏子（第一作者）和付古笋（通讯作者、《流行病》杂志的创始编辑）的文章，是因为西方主流媒体在普遍引用（我是崇洋的）。
今井夏子也参与过有关埃博拉、巴西黄热病流行趋势和国际风险的研究。
我估计“烦人”觉得此文不过是医学院公卫系本科生课后作业的水平，才发博评论的。
不多写了。“和为贵”。
“管轶：不想妄加评论，但有些专家讲话不要人为误导，譬如有人说武汉新型冠状病毒肺炎可防、可控、可治。但是否要进一步解释How（如何），即怎么防、如何控和怎么治这个问题。”“武汉新型冠状病毒肺炎根据官方首例发病是在12月12日，当时防护系统可能没有那么敏感，在医学上可能实际的早发病例要向前推大概半个月到一个月，因此最初的发病可能是11月20日-12月1日期间。
当年SARS疫情，首例发病时间是2002年11月16日，到次年1月底出现第一个“超级传播者”。今天已经是1月20日，这么看，这个病毒在人群传播和适应能力、以及发病情况和致病能力都跟早期的SARS发展曲线高度相似。
我希望我们能接受SARS的恶劣教训，也希望我们的防控情况和作风不要跟SARS高度相像，否则会在百姓和全球间引发负面影响”
看了一个预防帖子，说要多喝水，保持喉咙干燥，病毒不容易入侵。当然更要带口罩，少去人群密集地区。
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和预防流感的措施是一样的，还要加上一条：多洗手！少用手摸脸，特别是口鼻部位。
清醒一下，不要自以为是！：）
现在的情况是，全中国百姓应该感谢这位英国教授！！！
从昨天开始，全国开始报道新的病例，北京，上海，浙江，深圳，深圳是9例，其中一例是1月5号收诊的。
武汉对出境离汉人员进行管控…。
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哎呀，你自己愿意跪洋人你就自己跪吧，别拉扯上别人啊。你读过BBC发的原文吗？没读过吧？那你真的认为中国卫生部门、医学研究人员是看了BBC那篇文章才开始采取预防、检验措施的吗？
建议你在国内的亲属近期少往人多的地方去，出门戴口罩，这才是普通群众应该做的。如果你不具备基本的医学、生物学知识，就别在网上乱发言了，对你对别人都无益。
还是那句话：要相信党和政府，“不听谣，不传谣，不信谣”。
我现在要去运动了，回来后去问问小编，今天还是不是“Martin Luther King Day"
我肯定是建议，而不是争执。我与大家一样，每天极为关注。期待这次疫情能被控制住，大家平安！
http://sarsreference.com/sarsref/epidem.htm
本人帮苗大哥和烦人关于他们此文的回复见下，在此不再重复。下面是本人根据对该病及SARS的了解做一点前瞻性的观察。这个观察是基于几个事实和假设，因为其不确定性，本人不会做出模型，只是大致上说说：
事实: 武汉肺炎和萨斯都是冠状病毒，并且有75%左右的相似性，发病季节相同，都可能是动物传到人的。
假设：不难想象武汉肺炎会循SARS一样的规律流行，所以武汉从现在到三月份每天都会有新增的案例，严重程度是否和SARS相似，目前上不能确定。
历史资料：
下图是香港的SARS流行时的病例发现按月分布图，从图上可见，病例在刚开始发现的时候，会有一段时间的相对静止期（2月15日-3月初），然后病例会突然增多（三月八号），并在三月低的时候出现一次高峰，然后逐渐减少，这个趋势一直延续到五月中旬，然后出现零星案例，到五月低基本控制。
现状：
武汉肺炎从首个病例被发现到现在大概两个月了，按官方的统计，现在的病例总数在两百左右。除了武汉外，在国内外不少城市陆续出现了少量病例，最新消息称，在所有确诊病例中，武汉市有198例，北京市5例，广东省14例，上海1例。新增疑似病例中，四川省2例，云南省1例，上海市2例，广西壮族自治区1例，山东省1例。其中应该都有去过武汉的经历，说明到目前为止所有的病例都可以追溯到武汉。从这个分布看，武汉和广州之间的人口流动应该最大，其次是北京和其它地方。除了这些城市以外，在今后的两周内其它城市也会相继出现病人。
推测：
在今后一段时间（两个月左右），武汉和各地还会有更多的案例增加，而且随着春运的客流量的大幅提高和春节期间人们相互走动的增多，肺炎病毒在人群中扩散会加剧，所以从现在到春节后的个把月，案例会出现更大幅度的上扬并达到高峰，然后再会慢慢地回落，目前，香港仍未发生案例，但香港沦陷是迟早的事情，到时流行情况可能会和SARS一样，因为两者都是冠状病毒引起的肺炎。这个只是本博基于香港SARS流行特征做的一个推测。从目前的情况看，还很难断定未来的病人总数，可以肯定地说达到1750人是时间问题，而且最后的病人总数可能会是这个数字的两倍，这个苗大哥和烦人从来都没有质疑，他们质疑的是那文章的算法。
建议：国内卫生防疫部门，要在现有工作的基础上，进一步加强对病人的治疗，新病人的发现和处理及接触者的观察，同时，要做好更大规模即SARS级别的流行的心理，心态，人力和资源地准备。最主要的是不要再坚持不会有人人间的传播，因为这个病毒和SARS及MERS不仅是同种病毒，还有比较高的相似性，SARS及MERS能够干得到的，武汉肺炎也会干得到。所以，在防治和知会人民方面都不能掉以轻心。
所以，在一段相对稳定的时期后，案例会大量增加，直到高峰。
而且，烦人说的是文章发表时的情况，并没有说病例数不会达到那个数字，你应该好好的看看文章，文章批评的是当时的情况，并预计到传染病的动态性，合情合理，不知你为什么那么不爽。
1，本文的目的是指出英国流行病大师的计算方法，或者所谓的“模型”拿三例以偏概全的可笑，这个依然有效。
2，文中很清楚的指出：“当然，这个病不会一下就被控制住，根据SARS和MERS的流行情况看，大概会持续八九个月才会得以控制，就是说从现在到六七月份，病例还会进一步增多。”，目前情况就是如此，没有什么大惊小怪的。
3，所谓爱国病毒的说法是基于“出国不出省”的现象。之所以出现这个现象是因为在流行发生早期，流行的规律还没有表现出来，在外地的头两三个案例，也可能出现在国内，也可能出现在国外。这就是为什么我质疑用三个案例看全局的做法。
4，苗大哥和烦人不过是为了科普一下，流行病学家的文章发表一点点浅见，没有打脸不打脸的说法，科学讲究严谨，这是苗烦的一贯认知，基于此，即使今天有更多的案例，他们依然会提出同样的质疑或批评，不存在打脸不打脸，请relax一下。
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国内其他城市不准报，港台现在没人去，你所谓的"目前情况并非如此"根本不成立；而且打脸来得极快，楼主还在坚持患者只有65-70人的说法，没料到文章刚贴出去，官宣新确诊病例一下增加了136例，你怎么解释？英国人可能是蹲在屋子里自己算出来的数字，他之所以这么做，是因为中方根本没有可信的数据。楼主也恰恰忽略了这个关键，有意无意地忘了官宣的数字，无论确诊病例还是死亡人数都是假的。我们都是十几年前SARS的亲历者，当年一开始不也是拼命瞒报吗？
fanmaleinus
一开始以为是一个人呢，眼花了，:))
从昨天开始，全国开始报道新的病例，北京，上海，浙江，深圳，深圳是9例，其中一例是1月5号收诊的。
武汉对出境离汉人员进行管控…。
已经明确会人传人。武汉的许多人开始尽量不出门了…
大家都警觉了，事情才能控制！
发热门诊的医生朋友告诉我，隔离门诊病人非常之多，根本达不到有效隔离的标准，很多人口罩都不带，在门诊窜来窜去，听得我心都凉了。
https://en.wikipedia.org/wiki/2019–20_outbreak_of_novel_coronavirus_(2019-nCoV)
https://zh.wikipedia.org/zh-cn/2019–2020年武漢肺炎事件
一边是实实在在做事（学问/模型，一边是情绪化顺口而言，那个机率大可经的起时间考验？
三河匹夫 2020-01-19 14:55:13 回复 悄悄话 2020-01-19 "中国卫健委成立肺炎疫情应对领导小组 派组各省防控" . 这一下从武汉扩大到全国各省，看来帝国理工教授说的还是有分量的，即使是凭模型计算
2020年1月18日0—24时，治愈出院5例，新增病例59例，死亡1例;1月19日0—22时，治愈出院1例，新增病例77例。
我市在不断规范各级各类医疗机构预检分诊和发热门诊运行的基础上，按照新修订的新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案，进一步加大了新型冠状病毒感染的肺炎疑似病例筛查力度，同时进一步完善检测方案，优化检测流程，加快了检测速度。国家、省市专家组结合临床表现、流行病学史和病原学检测结果进行综合研判，1月18日新认定新型冠状病毒感染的肺炎确诊病例59例，1月19日新认定新型冠状病毒感染的肺炎确诊病例77例，两日共新确诊病例136例。
136例患者中，男性66例、女性70例；年龄最小的25岁，年龄最大的89岁；发病日期均在2020年1月18日前；首发症状大多为发热、咳嗽或胸闷、呼吸困难。根据新修订的诊疗方案，患者病情按照轻、重和危重进行分类，其中轻症100例、重症33例、危重症3例（其中死亡1例）。新增病例相关流行病学调查正在深入进行，其密切接触者也在追踪中。
截至1月19日22时，我市累计报告新型冠状病毒感染的肺炎病例198例，已治愈出院25例，死亡3例。目前仍在院治疗170例，其中轻症126例、重症35例、危重症9例，均在武汉市定点医疗机构接受隔离治疗。累计追踪密切接触者 817人，已解除医学观察727人，尚在接受医学观察90人，密切接触者中，没有发现相关病例。我们将继续对新发现的疑似病例及时进行采样检测。
冬春季是呼吸道传染病高发季节，也是病毒性肺炎的高发时期。专家提示，市民要注意防寒保暖、室内通风和个人卫生，加强体育锻炼，保持清淡饮食，避免到人群密集场所活动。有咳嗽、喷嚏时戴口罩或用纸巾、衣物遮挡口鼻以减少病菌传播。密切关注发热、咳嗽等症状，出现此类症状应及时就近就医。
2020年1月19日
http://wjw.wuhan.gov.cn/front/web/showDetail/2020012009077
才看到你昨晚的留言。
2020年1月5日中国疾控中心在美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI）网站上发布了由复旦大学的上海公共卫生临床中心和生物医学研究院研究员张永振等人发表的“Wuhan-Hu-1完整基因序列”第一版，于1月14日升级到第二版，1月17日升级到第3版。详见：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1798172431。
刚才我又去看了看2019-nCoV的基因序列：
从基因序列看，武汉病毒含有ORF1ab、ORF3a、ORF6、ORF7a、ORF8、ORF10等SARS中有的基因片段，难怪用IgM抗体SARS病毒检测试剂盒成阳性。
我们也知道美国CDC 不是美国军队，100余人对于CDC 来说，是不少的人。我们不会否认美国CDC的专业权威性。
那如何解释“爱国病毒” 一说？世界多国已证实有武汉来人带病，但湖北以外一例未报”的事实避实就虚。
Fanreninus 发表评论于 2020-01-19 09:52:25
回复 '三河匹夫' 的评论 : 谢谢你，好走！
三河匹夫 发表评论于 2020-01-19 09:31:45
辛苦你长篇论述，最后还是要公开不隐瞒才少生命损失，要不小道断不了。 另外别忘给你国内同窗会朋友发个贺电，武汉病毒能有爱国特征，战时有大用啊.
国内其它城市和地区没有报道发现病例应该是他们没有针对该病毒作专门的检验，所以只是当一般的流感、发烧治疗。该病毒是新近发现感染人，很可能目前只是武汉地区和北京卫生部掌握该病毒的检验方法，估计会很快由卫生部下发给各地卫生部门，所以在接下来的几个月里肯定会在国内其它地区发现该病患者。
不明白为什么这么多人着急。
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应该是这样。国家卫健委已经开始在全国下发诊断试剂盒，开始全国排查了
这儿的很多人不是急传染病，是急传染病为什么没有迅速传播
不明白为什么这么多人着急。
谢谢您的分析，您是从事什么行业的，是流行病学吗？
多加一句，不要和某些人计较，请继续分析最新进展
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这是否认了你所说的这一例吧？
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那么相信官方还是相信你呢？ 小道更准，宁愿信你说的，官方从头就没负责任完全公开过。
一般来说，科学研究和数据分析中的最常用的人为制造的数据叫做 Data Simulation。第一种情况常常是因为用于研究分析的 Sample Size不够大，所以在建模或者数据分析之后，要来进一步确认和验证结果的可靠性, 如 Model Validation。一般用 Resampling 的办法产生更大的或者更多的具有类似的基本特质，但分布变化又不太相同的数据，用来确认模式和数学分析的结果正确性的概率。第二种情况是，必须根据所有现存的研究数据的参数 and/or 所有现成的研究结果或理论的结论产生Assumptions 来作出选择数据的参数 Parameters，并创造出新的数据。这种情况下，一般是必须要得到所有原来的研究的参数 and/or 结论，然后产生数据来做分析。并且, 这种情况下往往是研究者的主观性参与比较强，可以产生很多不同结果来供参考。当然，也完全可能被选择和被应用成为误导性结论。所以英国人的结论可以是几百个几千个甚至几万个感染病例。同意博主的分析，传染病的流行病学现象是非常复杂的，有那么多的各种因素参与其中。所以还需要时间来观察得出最后的结论吧。 谢谢好文分享
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这是否认了你所说的这一例吧？
而是如何增强百姓防护意识，尤其是春运期间，武汉地处全国中心，高铁人流数目越来越大，应该不仅是武汉地区应该有对该病毒感染的防护意识！
我刚看了一张武汉同济医院医生全身防护衣罩的照片，三个来访者，仅仅两个人带口罩，另外一个女士没有意识到不带口罩的潜在危险。
“武汉肺炎持续扩张，除了香港、泰国及越南外，日本日前证实出现第一例武汉肺炎病例。奇怪的是，在拥有14亿人口的中国大陆，却没有在其他省市传出疫情。为何武汉肺炎在大陆只钟情于武汉人呢？”
“如果要让人相信中国公布的数字的真实性，唯一合理的逻辑推论，就是中国人事先吃了解药，否则为何这种病菌只会选择性袭击离开大陆的人呢？”
“微博上，也有不少网友留言质疑，“全国其他地方人民都没事，武汉不明肺炎就只会‘青睐’香港人？”、“难道武汉人只去香港没到内地其他地方？”
重在防护吧。如果不把情况说严重一点，很多人其实根本不care，去医院连口罩都不带的。
2)Currently infections/disease is developing, there is not much information/basis to predict infectivity and attach rate. In retrospect of SARS pandemic, the Ro is between 2-3 and attach rate is 10-60%. Early detection and active medical surveillance should quickly reduce R1 below 1 and control virus spreading.
3) Best wishes for people fighting at the confront line in Wuhan
2)Currently infections/disease is developing, there is not much information/basis to predict infectivity and attach rate. In retrospect of SARS pandemic, the Ro is between 2-3 and attach rate is 10-60%. Early detection and active medical surveillance should quickly reduce R1 below 1 and control virus spreading.
3) Best wishes for people fighting at the confront line in Wuhan
不过像“Business Insider”、“CBS 5:30pm 全国新闻联播”都采用了1732的说法。
看到一些报道：一线医护人员已加强了安全防护。
向你的“同窗和朋友”问候。