同时，毛泽东主席吸取金门战役失利的教训，就解放海南岛问题给四野前委作了重要指示：“渡海作战完全与过去我军所有作战的经验不相同，即必须注意潮水与风向，必须集中能一次运载至少一个军（四、五万人）的全部兵力，与三天以上粮食，于敌前登陆建立稳固滩头阵地，随即独力攻进，而不依靠后援。”“海南岛之敌可能较金门敌人战力差些，但仍不可轻敌……以免重蹈金门覆辙。”12月31日，毛泽东主席在电示中又一次强调，进攻海南岛“以充分准备确有把握而后动作为原则，避免仓卒莽撞造成过失。”并指出“不要希望空军帮助”。第15兵团原拟在旧历年前即1月底2月初发起渡海登陆作战，后因准备工作来不及，遂向第四野战军和中央军委建议推迟。1950年1月10日，毛泽东主席于苏联莫斯科再次致电四野前委：“既然在旧历年前准备工作来不及则不要勉强。请令邓赖洪不依靠北风而依靠改装机器这个方向去准备……争取于春夏两季内解决海南岛问题。” “海南岛与金门岛情况不同的地方，一是有冯白驹的配合，二是敌军战斗力较差，只要一次运两万人登陆，又有军级指挥机构随同登陆，就能建立立足点，以待后续部队的续进。”毛泽东主席的指示是根据当时的国际国内形势和金门战役的经验教训而作出的，其中正确地阐明了渡海作战的特点，明确地规定了渡海工具和登陆方向，强调指出了战役的有利条件，特别是要求“争取于春夏两季内解决海南岛问题”。这是一个十分英明的战略决策，为野战军组织部署海南战役指明了方向。