这个问题应该说有两个方面的问题存在：第一个就是说常说的“万法唯识”与“三界唯心”是同还是异呢？这两个的关系是怎么样呢？其二就是唯识，跟哲学上的唯心论，是同还是异呢？有这两个方面的问题。因为要探讨这第二个面向的问题，就是说唯识跟哲学上的唯心论是同还是异，我们就必须要先了解唯识的真实意涵是什么，因此还是得要先来探讨第一个问题。
“三界唯心，万法唯识”，这一句话其实已经指陈了有情生命的实相，也显示了万法(万事万物)的本质。它的意思就是说，三界中的一切法，包括有漏法，以及一切的无漏有为法，都是因为八识心王而出生；乃至于无漏无为法，也是因为八识心王而才能显现；如果离了八识心王，就没有一切法可得，因此说“万法唯识”。十方三世一切的有漏无漏法，既然都因为八识心王而出生或者显现，而八识心王又依第八识以及无明才会现于三界中；可是众生的无明业种以及上烦恼的随眠，又都是由各自的第八识所执持而藉缘变现，变现出我们这个色身的正报，以及世界山河的依报，因此说“三界唯心”——三界一切法都唯依第八识心而有，依著第八识心而变现，以第八识为根本。
三界一切万法可分为五大类，称为五位。
第一位就是心法。一切法中以眼识、耳识、鼻识、舌识、身识、意识、末那识以及阿赖耶识这八个识，是三界万法中最重要的，是三界万法之王，所以称为八识心王.
因为接下来的第二位的五遍行、五别境、善十一、六根本烦恼，还有二十随烦恼以及四个不定，这总共五十一个心所有法，都是与八识心王相应，都是为八识心王所有。
乃至再接着第三位的色法(所有物质的东西)，包括了眼、耳、鼻、舌、身的五根，还有色、声、香、味、触的五尘，另外还有一个法处所摄色，总共十一个色法，都是由八识心王和五十一个心所有法，这二位法合起来共生而显示幻影幻灭的影像，这个色法(物质的东西)其实是幻影幻灭的影像。
然后第四位呢，是心不相应行法，里面像得、命根、众同分，乃至于说像生、老、方、时、数等等，总共有二十四个；这个二十四个心不相应行法，它就是由心王、心所有法以及色法，或者是由其中一位所显现，或者是说由二位、三位和合而显现，依这三个分位差别法，来说有这二十四个心不相应行法。
第五位是无为法，就是里面包括了虚空、择灭、非择灭、不动、想受灭、真如等六种无为法；这六种无为法它则是由前面的四个位的法，也就是心王、心所、色法以及心不相应行法和合而显示。三界，都是由心王、心所、色法、心不相应行法还有无为法，这五位法次第辗转地在三界中出生显现。
例如，欲界人间的有情，他必须有第八识阿赖耶识以及第七识末那识入胎，执持受精卵，藉著母血所供给的地、水、火、风四大，渐渐地变现五色根(眼、耳、鼻、舌、身)；随著五色根的渐渐圆满，末那识能够触法尘，就能生起了意识。那意识要依末那识触法尘而后才能现起，以末那识为意识生起以及运作的所依根，因此第七识末那识也称为意根。因为意根不是独独祂本身就能够自己存在的心，必须要依著第八识阿赖耶识才能够现行运作；意根也不能够执持有情受报出生到三界六道的业种，只有阿赖耶识才能够持种，才能够执持这些的业种。胎儿五色根圆满了，意识生起之后呢，眼耳鼻舌身的五识，或者一同生起，或者一个个渐渐地生起，就具足了八识。如果不具足八识心王，就无法具足领受人间色声香味触法的六尘，那就变成是一个残障者。
其次是色界四禅天的境界，必须要有第八识所变现的色界天身，然后第六识、第七识、第八识在初禅乃至四禅等至位中安住，才会有色界四禅天等等至位的境界。必须要有第八识依所执持过去生修学禅定净业的种子，变现色界天身；然后第八、第七、第六识，以及眼识、耳识、身识这三识，共同在等持位中现行运作，因为色界四禅天人鼻、舌二识已经不现行运作了；这样子才会有色界天人种种的说法、论法的聚会，以及一切的身口意行。所以，如果没有眼耳身意识、末那识以及阿赖耶识这六个识，就不能够具足色界天的一切境界。
再来则是无色界天境界，必须要有意识安住在无色界天境界当中，才有无色界天境界现前，才能够有无色界的有情。然而，意识在这四天已经极为微细，是意识细心；乃至到了非想非非想天，意识更加微细，已经是极细心。但是都不离第七识意根，如果离了第七识意根的话，意识就无法现起。又如果没有第八阿赖耶识执持无色界天的业种，就是异熟种，也不会有有情能在无色界天出生，领纳无色界天的境界。因此，无色界天也不能够离于六、七、八识而有，要依六、七、八识现行运作，才能够有无色界天有情以及无色界天的境界。
由此可知，如果没有八识心王，就不可能有三界六道的有情存在，畜生道、饿鬼道以及地狱中的有情都莫不如是。十法界中的六凡业道中的有漏法是这样子，四圣法道的无漏法也是这样子。比如说佛法界，最后身菩萨在人间成佛的时候，祂的身口意行已经完全是纯无漏的有为法；这无漏有为法还是必须要八识具足现行运作，才能够在人间托钵、饮食、尝味、嗅香，乃至于说说法度众。又如菩萨修学四禅八定具足，然后入了灭尽定，或者是说俱解脱阿罗汉入灭尽定，他的前六识完全地灭掉了，离开了见闻觉知，就像眠熟、闷绝，而且完全没有唿吸、脉搏，好像死亡一样；然而他并没有死亡，他的色身也不会烂坏，因为还有七、八两个识未离身。所以，无学菩萨以及俱解脱阿罗汉入灭尽定，仍然不能离开八识心王的七、八二识。
有情的色身包括眼、耳、鼻、舌、身等五色根，都各有扶尘根以及胜义根。扶尘根是有情外观可见可对的五色根，说眼如葡萄、耳如荷叶、鼻如悬胆、舌如半月、身如肉桶。五胜义根的话，则是不可见而可对的，就是外观上虽然不能见，但能以意识觉知它的性用存在；五胜义根聚集在头部，就是我们的大脑。这两种五根都是由阿赖耶识藉著意根、无明以及父母四大为缘所变生出来的，是阿赖耶识的所缘境。阿赖耶识藉著五扶尘根来触外五尘，然后在五胜义根处变现出犹如外五尘的内相分五尘境；意根触内相分五尘上的法尘，为了想要进一步觉知，就会让意识以及眼、耳、鼻、舌、身等五识现起；六识现起之后，便有了色、声、香、味、触五尘，以及五尘上的法尘相，出现于有情心中；乃至于观想所见的色，以及意识所见的，像韵味、风格等等这些的无表色，这个都是法处所摄色，这法处所摄色也可以现起。这样就具足了十一种色法。这十一种色法都是要依著八识心王以及五十一个心所法和合运作才能够现起，如果离开了八识心王以及五十一个心所法，就没有十一种色法可以现前。而这十一种色法在三界中现前，虽然不能够说没有，然而却没有真实不坏、能自己存在的体性；可以说是念念变异，终归坏灭，如影似有，而无实质。所以，它是八识心王以及五十一个心所法之所现影。
综合以上所述，三界一切的身、觉境界，就是身根与觉知了别的境界，都不能离开八识心王而有；若离开了八识心王，尚且不能有六根，何况有命根？何况有三界一切的万法？所以说，世出世间一切万法，都只是八识心王所生，因此说为“万法唯识”。
然而，如果要归结八识心王，那就只有一个心，就是第八阿赖耶识，又称为如来藏。我们眼耳鼻舌身还有意识，以及末那识，这七转识都是由阿赖耶识现起，因为出生五色根以及七转识的种子是由阿赖耶识所执持的。有情依著他的业来受报到六道中，所面对的种种的苦乐的果报境界，也都是由阿赖耶识的相分所显示的。这也就是说，三界一切众生的正报身，以及他种种苦乐境界的依报，都是第八识所现，所以才说“三界唯心”，都是唯这个阿赖耶识所现。不仅凡夫众生如此，四圣法道中的佛菩提道及三乘解脱道，也都是依八识心王而显现、而修、而证。只有常住而不变异的真如心如来藏，才可能出生诸法，才是一切法界的实相；凡是会断灭的法，会间断的法，或者是无始以来一直常住，但是未来也可以坏灭的法，都不可能出生万法。
我们探究到这个地方，应该已能够了解， “三界唯心，万法唯识”，这句话中所说的唯心、唯识的异同所在。唯心的“心”指的是第八阿赖耶识如来藏心；唯识的“识”指的则是眼识、耳识、鼻识、舌识、身识、意识、末那识以及阿赖耶识，共八个识。但是眼耳鼻舌身意以及末那识等这七转识，也都是由第八识所生所现，因此，归结到最后还是唯一的一心——阿赖耶识如来藏。
况且，“三界唯心，万法唯识”不是一种哲学思想，而是可以亲证、可以体验的法界事实，不是只是一个心中的想法或概念、观念而已；因为包括第七末那识意根以及第八阿赖耶识在内的八识心王，都是可以亲证而现前体验祂存在的。亲自领受八识心王一一自性之后，其实就是亲自验证了“三界唯心，万法唯识”的事实。
如果否定了意根与阿赖耶识的真实存在，主张没有第八识如来藏，妄称如来藏只是施设假立的名相，就是只承认说一切有情众生只有眼识、耳识、鼻识、舌识、身识、意识这六个识；这样主张的人当然会进一步否定 “三界唯心，万法唯识”，认为那只是一种学说思想。但是，识阴六识都是生灭法，都没有能够自己存在的自体性；纵使是禅定境界中的意识细心，乃至到了非想非非想定当中的极细心，都莫不如是，都没有自己能够存在的自体性。从前面的说明当中，已经可以了解这一点：这样子生灭变异、甚至只有一世的这六个心识，又怎么能够成就“三界唯心，万法唯识”呢？
常说的“万法唯识”与“三界唯心”是同、是异，还有它的关系，这个问题探讨到这里。虽然我们还没有开始探讨，唯识与哲学上的唯心论是同是异这个问题；但是，相信对于哲学有所涉猎的人，这个问题的答案其实已经呼之欲出。因为哲学上的唯心论是相对于唯物论而说，就是在哲学的基本问题上，主张精神意识为第一性，物质为第二性；也就是主张物质依赖意识而存在，物质是意识的产物。然而，不论主张怎么样形式的唯心论，他所说的精神意识这个心，或者是合眼耳鼻舌身意六个识为一个心，或者是特别就意识而说，乃至于最多说到属于意根极小部分体性的潜意识，但是根本都没有碰触到第八阿赖耶识如来藏。这样子他们所说的唯心，与所说“三界唯心，万法唯识”中所说的唯心、唯识，那当然就大大的不同。
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