不少台湾人对大陆民航局在海峡中线大陆一侧新画设的M503航线强烈不满，坚决反对。他们预设解放军的军机一定会飞过来，觉得台湾空军和民航部门没有能力区分军机跟民航机。他们预设大陆对台湾极不友善，于是就又上演了一场逢中必反的闹剧。
这些台湾人希望，大陆一开始筹划新航线之前先跟台湾讨论，让台湾思考这些问题，评估风险，如果可以接受了、就签下两国协议，再去国际民航组织申请这个航道。
大陆不停地解释说解放军飞机不可能飞过去。其实这不是问题的关键。
关键是这些台湾人气愤大陆又一次没有把台湾当做一个独立的国家给予尊重。他们希望大陆应该按国际惯例，如果有一个新航道会飞在国界，那必须要两国先协议好，讨论若因为不幸越界造成的纠纷两国要怎样处理。以及飞机若越界另一国应该有权力把飞机打下来而不需要担负赔偿义务等等事宜。当两国都有共识以后，再去跟国际民航组织申请航道。
但是中国大陆在公告航线之前，申请这个靠近海峡中线航路的过程中，完全没有事先跟台湾知会过， 进行国与国之间的谈判。台独分子认为这就意味着大陆觉得不需要跟台湾知会。他们相信，假设这个航道那边不是台湾，而是一个正常国家，比如日本的话，中国大陆画这个航线以前，当然一定会知会那个国家。
所以，台独分子认为， M503航线事件，说到底还是中国对台湾的态度问题。表明了大陆根本没有把台湾跟中国当成是两个不同的国家，而是中国的一部分。不是他们梦想的那种国与国关系。这就让他们气急败坏，当然要闹一闹。
在台独分子看来， 大陆就是要用这个局来矮化台湾的国际地位，把台湾矮化成他们的一个地区。如果此时他们不闹一闹，那在国际看来就是台湾接受了这样的矮化。
他们认为，中国在很多事情上就是这样吃定台湾国际地位的弱势。知道台湾不是国际民航组织的会员国，遇到这种状况只能哑巴吃黄莲有苦说不出。如果这个时候他们不让国际上更多人去理解这个事情的严重性，以后如何跟国际发声，要全世界分清楚中国和台湾是不同的国家，那最后被统一，就只是时间的问题了。
在台独分子的梦里，大陆应该痛痛快快地承认台湾是个独立的国家。其实他们也知道，硬碰硬地武装斗争取得台湾独立地位，根本没有任何胜算，就算台湾人都打光了也不行。其实，这些台独分子个个都是嘴炮兵，没有一个愿意为台独流血牺牲的。就盼着有一天美国把中国打垮，或者中国发生内战，自行破碎，他们好趁机独立。
未来只要大陆是统一的，无论是什么人领导，都一定不会承认台湾是独立国家，都一定不会放弃统一， 因为人民不干，跟子孙后代无法交代。自秦以来的历史表明，追求国家统一的愿望是中国人DNA的一部分。