其次，从由地质变迁引起的气候变化看，我国的西南地区是茶树的原产地自喜马拉雅造山运动开始后，我国西南地区的地形发生了重大的改变，形成了川滇河谷和云贵高原，特别是近100万年以来，由于河谷的不断下切，高原的不断上升，使绝对高差达 5000～6500米，从而使西南地区既有起伏的群山，又有纵横交错的河谷，地形变化多端，以致形成了许许多多的小地貌区和小气候区，在低纬度和海拔高低相差悬殊的情况下，使平面与垂直气候分布差异很大，以致使原来生长在这里的茶树，慢慢地分别散布在热带、亚热带和温带气候之中。位于热带高温、多雨、炎热地带的，逐渐形成了温润、强日照的性状；位于温带气候中的，逐渐形成了耐寒、耐旱、耐荫的性状；位于上述两者之间的亚热带地区的，养成了喜温、喜湿的性状，从而使最初的茶树原种逐渐向两极延伸、分化，最终出现了茶树的种内变异，发展成了热带型和亚热带型的大叶种和中叶种茶树，以及温带型的中叶种和小叶种茶树。所以，我国植物分类学家关征镒在1980年出版的《中国植被》一书中指出：“我国的云南西北部、东南部、金沙江河谷、川东、鄂西和南岭山地，不仅是第三纪古热带植物区系的避难所，也是这些区系成分在古代分化发展的关键地区……这一地区是它们的发源地。”

同时，自第四纪以来，由于我国西南的某些地区，历经多次冰河期，如同其他植物一样，对茶树也造成了极大的灾难。云南由于受到冰河期灾害较轻，因此对那里的大叶种茶树影响较少，保存下来的野生大茶树就较多。按中国科学院的《中国区域地层表草案》所述：四川的受害地区主要在青衣江流域、峨嵋山区、大渡河流域和东部涪陵以东的乌江中下游一带。在川南、黔北、黔南等地受害较轻。虽然大批生长在冰河地区的茶树遭到毁灭性打击，但在受害较轻的四川南部和贵州一带，以及生长在河谷低地温暧地区的茶树得以生存，其后代就是今天零星分布在川南和贵州各地的野生大茶树。而通过自然筛选，向着温暖、湿润方向发展的，就成了大、中叶种的小乔木型茶树；向着抗寒、抗旱方向发展的，就成了中、小叶种的灌木型茶树，这就是我国西南地区，主要是云南、贵州、四川三省茶树，既有大叶种、中叶种和小叶种茶树存在，又有乔木型、小乔木型和灌木型茶树混杂生存的原因所在。植物学家认为：某种植物变异最多的地方，就是这种植物起源的中心地。我国西南三省，是我国茶树变异最多、资源最丰富的地方，当然是茶树起源的中心地了。

为了多产芽叶和方便采收，我们的先民就选择了中、小叶种的灌木型茶树人工栽培，这就是今天我们在茶园中常见到的茶树。知道了茶树是为何及如何变异分化的，对最原始的茶树是乔木型的，也就不觉得奇怪了。

第三，从山茶科植物的自然分布看，前苏联学者乌鲁夫在《历史植物地理学》中指出：“许多属的起源中心在某一个地区的集中，指出了这一植物区系的发源中心。”截止目前为止，全世界山茶科植物共有23属，计380余种，而在我国就有15属，260余种，且大部分分布在云南、贵州和四川一带，并还在不断发现之中。已发现的山茶属约有100多种，在云贵高原就有60多种，其中以茶树种占最重要的地位（参见胡先骕《植物分类学简编》）。由于山茶科、山茶属植物在我国西南地区的高度集中，表明我国的西南地区就是山茶科植物，也是山茶属植物的发源中心，应当也是饮用茶的发源地。

最后，从茶树的进化类型看，我国的西南地区是茶树的原产地茶树在其系统发育的历史长河中，总是趋于不断进化之中的。因此，凡是原始型茶树比较集中的地区，应该就是茶树的原产地所在。茶学工作者的调查研究和观察分析表明：我国的西南三省及其毗邻地区的野生大茶树，具有原始型茶树的形态特征和生化特性，这也证明了我国的西南地区是茶树原产地的中心地带。

此外，还可以有细胞遗传学角度考察基因的“多样性”，在印度的茶树(因为是次生的)是不可能有。由于有这个优势，中国的茶叶就可能产生很多不同的种类或品种。当然，另外一个优势就是在面对剧烈的自然灾害前，中国的野茶树存活下来的可能性会很大。而印度就没有这两种优势了。苹果树发源自非洲，据最近的报道由于生态环境的持续恶化，苹果树发源地非洲的野苹果树恐在短期内遭灭顶之灾，相当令人焦心啊，尤其是对遗传植物学家来说。最近环保部门紧急叫停金沙江上游水电站的建设，以保护生物的原生态，这是很有必要的。

所以，从茶树的分布、地质的变迁、气候的变化等方面的大量资料，也都证实了我国是茶树原产地的结论。由此，中国是茶树的原产地遂成定论。